Stage : Mesure de fluorescence par pince foliaire en plein champ - 3 mois

ARVALIS - Institut du végétal est un organisme de recherche appliquée en pointe sur l’analyse de données capteurs pour l’agriculture. Au sein du partenariat AgroPhotonique avec Photonics-Bretagne, ARVALIS développe une approche innovante pour l’émergence de traits de phénotypage de la photosynthèse effective des couverts intégrables sur différents systèmes robotisés de phénotypage de plein champ. Ce travail s’inscrit dans le cadre d’une thèse avec le CNRS.

Ce stage s'inscrit dans le cadre de cette thèse visant à améliorer la compréhension de la répartition spatiale de la photosynthèse dans un couvert végétal. Le stagiaire aura pour mission de réaliser des mesures de fluorescence chlorophyllienne en plein champ à l'aide de pinces foliaires (FMS2, Pocket PEA et MultispeQ). Ces mesures seront comparées à celles obtenues avec un nouvel instrument photonique développé dans le cadre de la thèse. Le stagiaire travaillera en étroite collaboration avec le doctorant. Il sera amené à réaliser des mesures avec ce dernier à PhenoFIELD, Ouzouer-le-Marché (41240).

Objectifs et travaux à réaliser

Le stagiaire réalisera des mesures avec des pinces de fluorescence en plein champ, sur des plants de maïs. Il suivra un protocole de mesure écrit avec le doctorant. Il traitera ensuite les données (nettoyage, analyse statistique, interprétation physiologique). Les principales étapes du travail sont les suivantes :

• Prise   de   connaissance   des   signaux   de   fluorescence   chlorophyllienne   et   leur   interprétation physiologique.
• Formation à l’utilisation des pinces de fluorescence FMS2, Pocket PEA, MultispeQ en laboratoire à Lannion puis en extérieur afin de comprendre les contraintes de mesure en plein champ.
• Prise en main des outils statistiques (anova, ACP).
• Campagne de mesures en plein champ sur la plateforme de phénotypage PhenoField® à Ouzouer-le- Marché (41240). Plusieurs déplacements sont prévus durant le stage.
• Analyse des données et interprétation.
• Restitution des résultats et analyses.

Profil requis

• Permis B obligatoire
• Stage de niveau technicien en expérimentation: Ouvert au BTS, M1 et M2 agronomie et/ou photonique Programmation R ou python
• Fort intérêt pour l’expérimentation
• Autonome, rigoureux et méthodique
• Des connaissances en biophotonique est un plus

Informations complémentaires

• Lieu également possible sur Photonics Bretagne, 4 rue Louis de Broglie, 22300 Lannion, France
• Stage de 3 mois de juin à août